หลังเกิดเหตุเจ้าหน้าที่ตรวจคนเข้าเมืองสระแก้ว ศุลกากร ตำรวจ สภ.คลองลึก และกำลังทหารพรานที่ 1201 ต้องเข้าไปเจรจาร่วมกับเจ้าหน้าที่ตรวจคนเข้าเมืองฝั่งกัมพูชาเพื่อไม่ให้เกิดเหตุวุ่นวายขึ้น โดยใช้เวลาชี้แจงประมาณ 30 นาที จนชาวกัมพูชาเข้าใจถึงสถานการณ์ว่าประเทศไทยมีการประกาศ พ.ร.ก.ฉุกเฉิน เพิ่มเติม เพื่อปิดด่านชายแดนไปแบบไม่มีกำหนด ก่อนที่ทั้งหมดจะสลายตัวไป เช่นเดียวกับที่ทางการกัมพูชาประกาศปิดด่านชายแดนไปจนถึงวันที่ 30 เม.ย.2563 นี้ เนื่องจากสถานการณ์ระบาดของโรคติดเชื้อไวรัสโคโรนา 2019 หรือ โควิด-19 ทวีความรุนแรงมากขึ้น
ล่าสุด เจ้าหน้าที่สามารถเปิดด่านผ่านแดนถาวรบ้านคลองลึก อ.อรัญประเทศ ให้เฉพาะรถขนส่งสินค้าสามารถข้ามแดนได้ปกติแล้ว