สำหรับคดีดังกล่าว มีจุดเริ่มต้นจากปมความขัดแย้งภายในของสหกรณ์เครดิตยูเนี่ยนคลองจั่น เมื่อปี 2556 และเกิดข้อร้องเรียน จนกรมสอบสวนคดีพิเศษ หรือ DSI เข้าไปตรวจสอบพบมีการยักยอกเงินโดยจ่ายเช็ค 878 ฉบับวงเงินกว่า 10,000 ล้านบาท จนทำให้สหกรณ์ฯ ขาดสภาพคล่อง นำไปสู่การออกหมายจับดำเนินคดีกับ นายศุภชัย ศรีศุภอักษร อดีตประธานสหกรณ์ฯ ในคดีฉ้อโกงและยักยอกทรัพย์
ขณะที่จากการตรวจสอบเส้นทางการเงิน พบเงินถูกถ่ายเทให้กับคน 6 กลุ่ม หนึ่งในนั้นคือวัดพระธรรมกาย พระธัมมชโย มูลนิธิมหารัตน อุบาสิกาจันทร์ขนนกยูง เครือข่ายพระและอดีตพระลูกวัด ซึ่งได้รับเช็ค 43 ฉบับรวมเป็นเงิน 932 ล้านบาท โดยมีการนำเงินไปสร้างอาคาร ซื้อที่ดินและเล่นหุ้น นำไปสู่การออกหมายจับพระธัมมชโยและพวกในคดีสมคบกันฟอกเงินและรับของโจร
โดยนับตั้งแต่ช่วงกลางปี 2559 ถึงต้นปี 2560 เจ้าหน้าที่ได้ส่งกำลังเข้าปิดล้อมตรวจค้นวัดพระธรรมกาย เพื่อจับกุมพระธัมมชโยแล้วถึง 3 ครั้ง แต่ก็คว้าน้ำเหลว จนถึงขณะนี้ผ่านมานานกว่า 4 ปี ก็ยังไม่สามารถจับตัวพระธัมมชโยมาดำเนินคดีได้