นพ.ชลน่าน กล่าวต่อว่า วันที่ 5 เมษายน 2566 กรรมการบริหารพรรคเพื่อไทยและตัวแทนสาขา จะเคาะรายชื่อแคนดิเดตนายกรัฐมนตรี ส่วนตัวเห็นว่าบุคคลที่ถูกเสนอชื่อเป็นแคนดิเดตนายกรัฐมนตรี ควรลงสมัคร สส. แบบบัญชีรายชื่อด้วย เพื่อให้สอดคล้องกับที่พรรคเพื่อไทยเคยยื่นแก้กฎหมาย ให้นายกรัฐมนตรีต้องมาจาก สส. แต่ทั้งนี้ก็ขึ้นอยู่กับความประสงค์ว่าที่แคนดิเดตนายกรัฐมนตรีด้วย เพราะกฎหมายไม่ได้กำหนดไว้
ส่วนกรณีของพรรครวมไทยสร้างชาติ ที่จะเสนอชื่อ พล.อ.ประยุทธ์ จันทร์โอชา เป็นแคนดิเดตนายกรัฐมนตรีนั้น นพ.ชลน่าน เชื่อว่า พล.อ.ประยุทธ์ จะไม่ลงสมัคร สส.แบบบัญชีรายชื่อ แต่มองว่าหาก พล.อ.ประยุทธ์ อยากเป็นประชาธิปไตยที่แท้จริง ก็ควรให้ความสำคัญกับสภาผู้แทนราษฎรด้วย เพราะหากเป็น สส.จะได้เห็นว่าสภาผู้แทนราษฎรมีความสำคัญอย่างไร